Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NBPF1Q3BBV0 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NBPF1Q3BBV0 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms