Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FHOD3Q2V2M9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FHOD3Q2V2M9 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FHOD3Q2V2M9 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FHOD3Q2V2M9 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FHOD3Q2V2M9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FHOD3Q2V2M9 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FHOD3Q2V2M9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FHOD3Q2V2M9 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FHOD3Q2V2M9 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FHOD3Q2V2M9 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FHOD3Q2V2M9 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FHOD3Q2V2M9 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
FHOD3Q2V2M9 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
FHOD3Q2V2M9 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FHOD3Q2V2M9 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FHOD3Q2V2M9 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FHOD3Q2V2M9 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FHOD3Q2V2M9 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FHOD3Q2V2M9 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FHOD3Q2V2M9 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FHOD3Q2V2M9 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FHOD3Q2V2M9 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FHOD3Q2V2M9 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FHOD3Q2V2M9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FHOD3Q2V2M9 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FHOD3Q2V2M9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FHOD3Q2V2M9 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FHOD3Q2V2M9 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FHOD3Q2V2M9 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FHOD3Q2V2M9 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FHOD3Q2V2M9 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FHOD3Q2V2M9 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FHOD3Q2V2M9 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FHOD3Q2V2M9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FHOD3Q2V2M9 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FHOD3Q2V2M9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FHOD3Q2V2M9 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FHOD3Q2V2M9 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FHOD3Q2V2M9 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FHOD3Q2V2M9 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FHOD3Q2V2M9 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FHOD3Q2V2M9 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FHOD3Q2V2M9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FHOD3Q2V2M9 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FHOD3Q2V2M9 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FHOD3Q2V2M9 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FHOD3Q2V2M9 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FHOD3Q2V2M9 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FHOD3Q2V2M9 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
FHOD3Q2V2M9 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FHOD3Q2V2M9 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FHOD3Q2V2M9 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FHOD3Q2V2M9 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FHOD3Q2V2M9 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FHOD3Q2V2M9 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FHOD3Q2V2M9 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FHOD3Q2V2M9 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FHOD3Q2V2M9 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FHOD3Q2V2M9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FHOD3Q2V2M9 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FHOD3Q2V2M9 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FHOD3Q2V2M9 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FHOD3Q2V2M9 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
FHOD3Q2V2M9 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
FHOD3Q2V2M9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FHOD3Q2V2M9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FHOD3Q2V2M9 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms