Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF239Q16600 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF239Q16600 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms