Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSX1Q16384 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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