Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms