Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA3FQ13275 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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