Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms