Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
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