Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFIAQ12857 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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