Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LOXL1Q08397 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LOXL1Q08397 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LOXL1Q08397 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LOXL1Q08397 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LOXL1Q08397 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LOXL1Q08397 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LOXL1Q08397 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
LOXL1Q08397 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LOXL1Q08397 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LOXL1Q08397 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LOXL1Q08397 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LOXL1Q08397 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LOXL1Q08397 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms