Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAP1Q01518 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CAP1Q01518 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CAP1Q01518 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAP1Q01518 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CAP1Q01518 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAP1Q01518 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAP1Q01518 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAP1Q01518 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAP1Q01518 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAP1Q01518 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAP1Q01518 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAP1Q01518 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAP1Q01518 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAP1Q01518 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAP1Q01518 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CAP1Q01518 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAP1Q01518 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAP1Q01518 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAP1Q01518 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAP1Q01518 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAP1Q01518 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAP1Q01518 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAP1Q01518 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAP1Q01518 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAP1Q01518 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAP1Q01518 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAP1Q01518 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAP1Q01518 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CAP1Q01518 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAP1Q01518 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CAP1Q01518 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAP1Q01518 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAP1Q01518 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CAP1Q01518 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CAP1Q01518 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CAP1Q01518 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CAP1Q01518 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CAP1Q01518 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CAP1Q01518 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CAP1Q01518 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAP1Q01518 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAP1Q01518 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAP1Q01518 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAP1Q01518 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAP1Q01518 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAP1Q01518 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAP1Q01518 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAP1Q01518 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAP1Q01518 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAP1Q01518 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CAP1Q01518 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAP1Q01518 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAP1Q01518 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAP1Q01518 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CAP1Q01518 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAP1Q01518 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAP1Q01518 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAP1Q01518 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAP1Q01518 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CAP1Q01518 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAP1Q01518 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAP1Q01518 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAP1Q01518 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAP1Q01518 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAP1Q01518 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CAP1Q01518 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAP1Q01518 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAP1Q01518 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAP1Q01518 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAP1Q01518 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAP1Q01518 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAP1Q01518 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAP1Q01518 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAP1Q01518 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAP1Q01518 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAP1Q01518 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CAP1Q01518 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAP1Q01518 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAP1Q01518 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAP1Q01518 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAP1Q01518 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAP1Q01518 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAP1Q01518 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAP1Q01518 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAP1Q01518 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAP1Q01518 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAP1Q01518 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAP1Q01518 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAP1Q01518 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAP1Q01518 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAP1Q01518 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAP1Q01518 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAP1Q01518 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CAP1Q01518 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAP1Q01518 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAP1Q01518 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAP1Q01518 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAP1Q01518 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAP1Q01518 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms