Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA1BQ00975 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms