Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CSNK2A1P68400 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms