Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HERVK_113P62684 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERVK_113P62684 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms