Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP9P55211 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP9P55211 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP9P55211 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP9P55211 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP9P55211 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP9P55211 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP9P55211 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP9P55211 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP9P55211 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP9P55211 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP9P55211 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP9P55211 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP9P55211 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP9P55211 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP9P55211 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP9P55211 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP9P55211 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP9P55211 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP9P55211 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP9P55211 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP9P55211 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP9P55211 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP9P55211 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP9P55211 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP9P55211 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP9P55211 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP9P55211 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP9P55211 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP9P55211 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP9P55211 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP9P55211 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP9P55211 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP9P55211 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP9P55211 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP9P55211 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP9P55211 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP9P55211 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP9P55211 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP9P55211 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP9P55211 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP9P55211 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP9P55211 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP9P55211 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP9P55211 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP9P55211 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP9P55211 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP9P55211 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP9P55211 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP9P55211 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP9P55211 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP9P55211 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP9P55211 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP9P55211 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP9P55211 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP9P55211 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP9P55211 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP9P55211 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP9P55211 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP9P55211 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP9P55211 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP9P55211 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP9P55211 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP9P55211 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP9P55211 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP9P55211 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP9P55211 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP9P55211 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP9P55211 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP9P55211 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP9P55211 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP9P55211 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP9P55211 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP9P55211 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP9P55211 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP9P55211 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP9P55211 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP9P55211 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP9P55211 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP9P55211 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP9P55211 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP9P55211 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP9P55211 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP9P55211 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP9P55211 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP9P55211 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP9P55211 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP9P55211 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP9P55211 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP9P55211 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP9P55211 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP9P55211 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP9P55211 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP9P55211 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP9P55211 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP9P55211 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP9P55211 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP9P55211 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP9P55211 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP9P55211 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms