Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV1P50549 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV1P50549 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV1P50549 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV1P50549 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV1P50549 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV1P50549 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV1P50549 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV1P50549 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV1P50549 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV1P50549 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV1P50549 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV1P50549 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV1P50549 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV1P50549 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV1P50549 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV1P50549 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV1P50549 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV1P50549 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV1P50549 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV1P50549 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV1P50549 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV1P50549 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV1P50549 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV1P50549 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV1P50549 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV1P50549 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV1P50549 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV1P50549 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV1P50549 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV1P50549 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV1P50549 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETV1P50549 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETV1P50549 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETV1P50549 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETV1P50549 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ETV1P50549 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETV1P50549 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETV1P50549 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETV1P50549 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETV1P50549 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETV1P50549 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETV1P50549 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETV1P50549 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETV1P50549 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETV1P50549 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETV1P50549 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETV1P50549 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ETV1P50549 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETV1P50549 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETV1P50549 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ETV1P50549 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETV1P50549 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETV1P50549 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETV1P50549 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETV1P50549 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETV1P50549 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETV1P50549 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETV1P50549 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETV1P50549 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETV1P50549 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETV1P50549 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETV1P50549 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ETV1P50549 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETV1P50549 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETV1P50549 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETV1P50549 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETV1P50549 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETV1P50549 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETV1P50549 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETV1P50549 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETV1P50549 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETV1P50549 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETV1P50549 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETV1P50549 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETV1P50549 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETV1P50549 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETV1P50549 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETV1P50549 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETV1P50549 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETV1P50549 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETV1P50549 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETV1P50549 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETV1P50549 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETV1P50549 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ETV1P50549 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETV1P50549 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETV1P50549 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETV1P50549 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ETV1P50549 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETV1P50549 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETV1P50549 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETV1P50549 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETV1P50549 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETV1P50549 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETV1P50549 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETV1P50549 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ETV1P50549 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV1P50549 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ETV1P50549 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms