Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PIP4K2AP48426 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms