Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UTRNP46939 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
UTRNP46939 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UTRNP46939 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UTRNP46939 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UTRNP46939 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
UTRNP46939 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UTRNP46939 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UTRNP46939 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UTRNP46939 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
UTRNP46939 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UTRNP46939 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UTRNP46939 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UTRNP46939 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UTRNP46939 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UTRNP46939 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UTRNP46939 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UTRNP46939 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UTRNP46939 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
UTRNP46939 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UTRNP46939 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UTRNP46939 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UTRNP46939 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
UTRNP46939 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
UTRNP46939 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UTRNP46939 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
UTRNP46939 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UTRNP46939 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UTRNP46939 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UTRNP46939 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UTRNP46939 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UTRNP46939 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UTRNP46939 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UTRNP46939 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UTRNP46939 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UTRNP46939 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
UTRNP46939 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UTRNP46939 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UTRNP46939 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UTRNP46939 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UTRNP46939 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UTRNP46939 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UTRNP46939 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UTRNP46939 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UTRNP46939 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UTRNP46939 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UTRNP46939 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UTRNP46939 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UTRNP46939 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UTRNP46939 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UTRNP46939 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UTRNP46939 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UTRNP46939 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UTRNP46939 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UTRNP46939 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UTRNP46939 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UTRNP46939 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
UTRNP46939 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UTRNP46939 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
UTRNP46939 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UTRNP46939 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
UTRNP46939 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UTRNP46939 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UTRNP46939 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UTRNP46939 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
UTRNP46939 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UTRNP46939 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UTRNP46939 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UTRNP46939 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UTRNP46939 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UTRNP46939 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UTRNP46939 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UTRNP46939 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UTRNP46939 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UTRNP46939 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UTRNP46939 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UTRNP46939 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UTRNP46939 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UTRNP46939 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
UTRNP46939 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UTRNP46939 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UTRNP46939 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UTRNP46939 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UTRNP46939 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UTRNP46939 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
UTRNP46939 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UTRNP46939 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UTRNP46939 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UTRNP46939 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UTRNP46939 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UTRNP46939 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UTRNP46939 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UTRNP46939 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UTRNP46939 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UTRNP46939 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UTRNP46939 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UTRNP46939 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UTRNP46939 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UTRNP46939 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UTRNP46939 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms