Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRATP43155 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRATP43155 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRATP43155 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRATP43155 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRATP43155 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CRATP43155 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRATP43155 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRATP43155 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRATP43155 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRATP43155 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRATP43155 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRATP43155 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRATP43155 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRATP43155 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRATP43155 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRATP43155 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRATP43155 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRATP43155 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRATP43155 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRATP43155 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRATP43155 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRATP43155 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRATP43155 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRATP43155 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRATP43155 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRATP43155 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRATP43155 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRATP43155 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CRATP43155 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CRATP43155 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRATP43155 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRATP43155 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRATP43155 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRATP43155 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRATP43155 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRATP43155 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRATP43155 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRATP43155 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRATP43155 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRATP43155 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRATP43155 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRATP43155 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CRATP43155 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CRATP43155 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CRATP43155 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CRATP43155 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CRATP43155 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CRATP43155 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CRATP43155 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CRATP43155 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CRATP43155 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CRATP43155 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CRATP43155 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CRATP43155 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CRATP43155 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CRATP43155 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CRATP43155 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CRATP43155 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CRATP43155 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CRATP43155 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CRATP43155 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CRATP43155 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CRATP43155 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CRATP43155 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CRATP43155 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CRATP43155 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CRATP43155 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CRATP43155 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CRATP43155 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CRATP43155 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CRATP43155 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CRATP43155 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CRATP43155 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CRATP43155 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CRATP43155 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CRATP43155 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CRATP43155 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CRATP43155 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CRATP43155 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CRATP43155 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CRATP43155 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CRATP43155 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CRATP43155 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CRATP43155 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CRATP43155 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CRATP43155 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CRATP43155 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CRATP43155 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CRATP43155 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CRATP43155 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CRATP43155 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CRATP43155 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CRATP43155 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CRATP43155 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CRATP43155 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CRATP43155 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CRATP43155 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CRATP43155 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CRATP43155 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms