Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GJC1P36383 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GJC1P36383 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GJC1P36383 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GJC1P36383 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GJC1P36383 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GJC1P36383 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GJC1P36383 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GJC1P36383 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GJC1P36383 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GJC1P36383 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GJC1P36383 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GJC1P36383 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GJC1P36383 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GJC1P36383 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GJC1P36383 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GJC1P36383 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GJC1P36383 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GJC1P36383 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GJC1P36383 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GJC1P36383 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GJC1P36383 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GJC1P36383 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GJC1P36383 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GJC1P36383 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GJC1P36383 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GJC1P36383 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GJC1P36383 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GJC1P36383 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GJC1P36383 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GJC1P36383 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GJC1P36383 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GJC1P36383 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GJC1P36383 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GJC1P36383 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GJC1P36383 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GJC1P36383 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GJC1P36383 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GJC1P36383 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GJC1P36383 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GJC1P36383 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GJC1P36383 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GJC1P36383 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GJC1P36383 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GJC1P36383 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GJC1P36383 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GJC1P36383 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GJC1P36383 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GJC1P36383 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GJC1P36383 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GJC1P36383 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GJC1P36383 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GJC1P36383 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GJC1P36383 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GJC1P36383 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJC1P36383 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJC1P36383 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJC1P36383 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJC1P36383 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJC1P36383 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJC1P36383 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJC1P36383 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJC1P36383 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJC1P36383 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJC1P36383 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJC1P36383 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJC1P36383 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJC1P36383 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJC1P36383 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJC1P36383 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJC1P36383 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GJC1P36383 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJC1P36383 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJC1P36383 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJC1P36383 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJC1P36383 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJC1P36383 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJC1P36383 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJC1P36383 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJC1P36383 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJC1P36383 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJC1P36383 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJC1P36383 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJC1P36383 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJC1P36383 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJC1P36383 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJC1P36383 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJC1P36383 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GJC1P36383 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJC1P36383 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GJC1P36383 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJC1P36383 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJC1P36383 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJC1P36383 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJC1P36383 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJC1P36383 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJC1P36383 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJC1P36383 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJC1P36383 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJC1P36383 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.9 ms