Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDIT3P35638 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms