Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJA4P35212 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GJA4P35212 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GJA4P35212 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJA4P35212 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJA4P35212 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJA4P35212 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJA4P35212 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJA4P35212 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJA4P35212 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJA4P35212 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJA4P35212 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJA4P35212 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJA4P35212 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJA4P35212 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJA4P35212 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJA4P35212 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJA4P35212 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJA4P35212 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJA4P35212 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJA4P35212 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJA4P35212 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJA4P35212 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GJA4P35212 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJA4P35212 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GJA4P35212 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GJA4P35212 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJA4P35212 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJA4P35212 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJA4P35212 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJA4P35212 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJA4P35212 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJA4P35212 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJA4P35212 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJA4P35212 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJA4P35212 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJA4P35212 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJA4P35212 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJA4P35212 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJA4P35212 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJA4P35212 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJA4P35212 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJA4P35212 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJA4P35212 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJA4P35212 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJA4P35212 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJA4P35212 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GJA4P35212 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJA4P35212 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJA4P35212 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJA4P35212 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GJA4P35212 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJA4P35212 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GJA4P35212 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GJA4P35212 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJA4P35212 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJA4P35212 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJA4P35212 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJA4P35212 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJA4P35212 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJA4P35212 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJA4P35212 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJA4P35212 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJA4P35212 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJA4P35212 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJA4P35212 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GJA4P35212 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJA4P35212 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJA4P35212 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJA4P35212 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJA4P35212 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJA4P35212 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJA4P35212 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJA4P35212 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJA4P35212 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJA4P35212 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJA4P35212 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJA4P35212 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GJA4P35212 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJA4P35212 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GJA4P35212 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJA4P35212 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GJA4P35212 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJA4P35212 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJA4P35212 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJA4P35212 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJA4P35212 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJA4P35212 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJA4P35212 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GJA4P35212 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJA4P35212 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJA4P35212 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJA4P35212 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJA4P35212 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJA4P35212 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJA4P35212 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJA4P35212 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJA4P35212 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJA4P35212 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJA4P35212 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms