Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 AL109653.2-201ENST00000625029 1065 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 PDCL3P7-201ENST00000392251 712 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 AC211433.1-202ENST00000434256 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 AMN1-212ENST00000542781 879 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 AC013652.1-204ENST00000558209 489 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 BOLA2P2-202ENST00000604904 567 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 RPS27L-208ENST00000635699 693 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 ATF2-207ENST00000409833 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 AC092474.1-201ENST00000416158 1167 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 LINC01424-201ENST00000417820 1031 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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HOXD11P31277 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 AC021820.1-201ENST00000525564 808 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 AC103982.1-201ENST00000561358 571 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 AC139099.1-203ENST00000570366 607 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 AC023389.2-201ENST00000580031 955 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 AC008991.2-201ENST00000587850 487 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 MAGEB5-201ENST00000602297 1216 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 MND1-206ENST00000622785 830 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 LINC01358-209ENST00000635072 1114 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 AC093390.2-202ENST00000638236 976 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD11P31277 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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