Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID4AP29374 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms