Protein–RNA interactions for Protein: P29353

SHC1, SHC-transforming protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC1P29353 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHC1P29353 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHC1P29353 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHC1P29353 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHC1P29353 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHC1P29353 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHC1P29353 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHC1P29353 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHC1P29353 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHC1P29353 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHC1P29353 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHC1P29353 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHC1P29353 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHC1P29353 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SHC1P29353 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHC1P29353 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SHC1P29353 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHC1P29353 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHC1P29353 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHC1P29353 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHC1P29353 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHC1P29353 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHC1P29353 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SHC1P29353 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHC1P29353 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHC1P29353 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SHC1P29353 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SHC1P29353 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SHC1P29353 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SHC1P29353 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SHC1P29353 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SHC1P29353 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SHC1P29353 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SHC1P29353 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SHC1P29353 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SHC1P29353 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SHC1P29353 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SHC1P29353 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SHC1P29353 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHC1P29353 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHC1P29353 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHC1P29353 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHC1P29353 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHC1P29353 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHC1P29353 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHC1P29353 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHC1P29353 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHC1P29353 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHC1P29353 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHC1P29353 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHC1P29353 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHC1P29353 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHC1P29353 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHC1P29353 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHC1P29353 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHC1P29353 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SHC1P29353 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHC1P29353 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHC1P29353 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHC1P29353 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SHC1P29353 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHC1P29353 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHC1P29353 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHC1P29353 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHC1P29353 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHC1P29353 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHC1P29353 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHC1P29353 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHC1P29353 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHC1P29353 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHC1P29353 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHC1P29353 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHC1P29353 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHC1P29353 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHC1P29353 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHC1P29353 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHC1P29353 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHC1P29353 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHC1P29353 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHC1P29353 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHC1P29353 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SHC1P29353 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHC1P29353 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHC1P29353 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHC1P29353 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHC1P29353 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHC1P29353 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHC1P29353 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHC1P29353 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHC1P29353 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHC1P29353 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHC1P29353 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHC1P29353 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHC1P29353 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SHC1P29353 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHC1P29353 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHC1P29353 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHC1P29353 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SHC1P29353 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SHC1P29353 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms