Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HTR2AP28223 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms