Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-DMAP28067 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms