Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATF3P18847 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATF3P18847 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATF3P18847 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATF3P18847 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATF3P18847 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATF3P18847 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATF3P18847 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATF3P18847 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATF3P18847 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATF3P18847 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATF3P18847 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ATF3P18847 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATF3P18847 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATF3P18847 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATF3P18847 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATF3P18847 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATF3P18847 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATF3P18847 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATF3P18847 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATF3P18847 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATF3P18847 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATF3P18847 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATF3P18847 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATF3P18847 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATF3P18847 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATF3P18847 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ATF3P18847 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATF3P18847 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATF3P18847 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATF3P18847 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATF3P18847 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATF3P18847 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATF3P18847 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATF3P18847 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.6
ATF3P18847 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATF3P18847 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATF3P18847 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATF3P18847 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATF3P18847 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATF3P18847 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATF3P18847 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ATF3P18847 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATF3P18847 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATF3P18847 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATF3P18847 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATF3P18847 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATF3P18847 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATF3P18847 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATF3P18847 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATF3P18847 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATF3P18847 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ATF3P18847 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATF3P18847 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATF3P18847 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATF3P18847 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATF3P18847 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATF3P18847 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATF3P18847 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ATF3P18847 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATF3P18847 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATF3P18847 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATF3P18847 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ATF3P18847 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATF3P18847 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATF3P18847 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATF3P18847 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ATF3P18847 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATF3P18847 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATF3P18847 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATF3P18847 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATF3P18847 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATF3P18847 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ATF3P18847 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ATF3P18847 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATF3P18847 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATF3P18847 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATF3P18847 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATF3P18847 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATF3P18847 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATF3P18847 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATF3P18847 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATF3P18847 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATF3P18847 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATF3P18847 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ATF3P18847 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ATF3P18847 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATF3P18847 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATF3P18847 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATF3P18847 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATF3P18847 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATF3P18847 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATF3P18847 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATF3P18847 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATF3P18847 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATF3P18847 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATF3P18847 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ATF3P18847 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATF3P18847 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATF3P18847 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms