Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2A2P16615 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms