Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PGA3P0DJD8 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PGA3P0DJD8 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms