Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NGFRP08138 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NGFRP08138 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NGFRP08138 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NGFRP08138 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NGFRP08138 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NGFRP08138 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NGFRP08138 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NGFRP08138 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NGFRP08138 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NGFRP08138 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NGFRP08138 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NGFRP08138 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NGFRP08138 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NGFRP08138 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NGFRP08138 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NGFRP08138 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NGFRP08138 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NGFRP08138 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NGFRP08138 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NGFRP08138 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NGFRP08138 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NGFRP08138 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NGFRP08138 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NGFRP08138 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NGFRP08138 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NGFRP08138 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NGFRP08138 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NGFRP08138 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NGFRP08138 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NGFRP08138 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NGFRP08138 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NGFRP08138 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NGFRP08138 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NGFRP08138 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NGFRP08138 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NGFRP08138 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NGFRP08138 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NGFRP08138 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NGFRP08138 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NGFRP08138 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NGFRP08138 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NGFRP08138 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NGFRP08138 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NGFRP08138 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NGFRP08138 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NGFRP08138 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NGFRP08138 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NGFRP08138 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NGFRP08138 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NGFRP08138 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NGFRP08138 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NGFRP08138 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NGFRP08138 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NGFRP08138 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NGFRP08138 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NGFRP08138 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NGFRP08138 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NGFRP08138 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NGFRP08138 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NGFRP08138 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NGFRP08138 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NGFRP08138 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NGFRP08138 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NGFRP08138 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NGFRP08138 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NGFRP08138 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NGFRP08138 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NGFRP08138 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NGFRP08138 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NGFRP08138 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NGFRP08138 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NGFRP08138 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NGFRP08138 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NGFRP08138 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NGFRP08138 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NGFRP08138 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NGFRP08138 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NGFRP08138 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NGFRP08138 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NGFRP08138 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NGFRP08138 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NGFRP08138 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NGFRP08138 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NGFRP08138 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NGFRP08138 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NGFRP08138 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NGFRP08138 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NGFRP08138 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NGFRP08138 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NGFRP08138 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NGFRP08138 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NGFRP08138 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NGFRP08138 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NGFRP08138 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NGFRP08138 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NGFRP08138 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NGFRP08138 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NGFRP08138 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NGFRP08138 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms