Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEFMP07197 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEFMP07197 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEFMP07197 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEFMP07197 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEFMP07197 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEFMP07197 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEFMP07197 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEFMP07197 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEFMP07197 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEFMP07197 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEFMP07197 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEFMP07197 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEFMP07197 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEFMP07197 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEFMP07197 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEFMP07197 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEFMP07197 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NEFMP07197 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEFMP07197 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEFMP07197 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEFMP07197 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEFMP07197 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NEFMP07197 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NEFMP07197 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEFMP07197 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEFMP07197 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEFMP07197 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEFMP07197 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEFMP07197 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEFMP07197 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEFMP07197 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEFMP07197 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEFMP07197 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEFMP07197 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEFMP07197 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEFMP07197 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEFMP07197 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NEFMP07197 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEFMP07197 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEFMP07197 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEFMP07197 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NEFMP07197 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NEFMP07197 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEFMP07197 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEFMP07197 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEFMP07197 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEFMP07197 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NEFMP07197 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEFMP07197 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEFMP07197 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEFMP07197 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEFMP07197 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEFMP07197 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEFMP07197 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEFMP07197 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEFMP07197 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NEFMP07197 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEFMP07197 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEFMP07197 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEFMP07197 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEFMP07197 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEFMP07197 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEFMP07197 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEFMP07197 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEFMP07197 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEFMP07197 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NEFMP07197 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEFMP07197 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEFMP07197 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEFMP07197 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEFMP07197 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEFMP07197 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEFMP07197 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NEFMP07197 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEFMP07197 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEFMP07197 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEFMP07197 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEFMP07197 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEFMP07197 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEFMP07197 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEFMP07197 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEFMP07197 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NEFMP07197 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NEFMP07197 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEFMP07197 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEFMP07197 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NEFMP07197 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEFMP07197 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEFMP07197 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEFMP07197 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEFMP07197 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEFMP07197 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEFMP07197 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEFMP07197 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEFMP07197 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEFMP07197 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEFMP07197 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEFMP07197 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEFMP07197 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms