Protein–RNA interactions for Protein: O94759

TRPM2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM2O94759 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRPM2O94759 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRPM2O94759 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRPM2O94759 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRPM2O94759 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRPM2O94759 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRPM2O94759 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TRPM2O94759 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRPM2O94759 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRPM2O94759 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TRPM2O94759 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRPM2O94759 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRPM2O94759 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TRPM2O94759 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRPM2O94759 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRPM2O94759 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRPM2O94759 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRPM2O94759 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TRPM2O94759 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms