Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
ABCC9O60706 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
ABCC9O60706 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
ABCC9O60706 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
ABCC9O60706 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
ABCC9O60706 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
ABCC9O60706 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
ABCC9O60706 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
ABCC9O60706 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
ABCC9O60706 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
ABCC9O60706 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
ABCC9O60706 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
ABCC9O60706 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
ABCC9O60706 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
ABCC9O60706 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
ABCC9O60706 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
ABCC9O60706 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
ABCC9O60706 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
ABCC9O60706 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
ABCC9O60706 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
ABCC9O60706 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
ABCC9O60706 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
ABCC9O60706 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
ABCC9O60706 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
ABCC9O60706 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
ABCC9O60706 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
ABCC9O60706 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
ABCC9O60706 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
ABCC9O60706 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
ABCC9O60706 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
ABCC9O60706 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
ABCC9O60706 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
ABCC9O60706 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
ABCC9O60706 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
ABCC9O60706 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
ABCC9O60706 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
ABCC9O60706 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
ABCC9O60706 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
ABCC9O60706 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
ABCC9O60706 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
ABCC9O60706 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
ABCC9O60706 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
ABCC9O60706 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
ABCC9O60706 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
ABCC9O60706 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
ABCC9O60706 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
ABCC9O60706 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
ABCC9O60706 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC36.07■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC36.06■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC36.05■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC36.04■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC36.03■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
ABCC9O60706 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms