Protein–RNA interactions for Protein: O60312

ATP10A, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP10AO60312 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP10AO60312 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP10AO60312 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP10AO60312 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP10AO60312 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP10AO60312 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP10AO60312 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP10AO60312 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP10AO60312 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP10AO60312 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP10AO60312 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP10AO60312 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP10AO60312 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP10AO60312 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP10AO60312 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP10AO60312 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP10AO60312 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms