Protein–RNA interactions for Protein: O15194

CTDSPL, CTD small phosphatase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPLO15194 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSPLO15194 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSPLO15194 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSPLO15194 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSPLO15194 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSPLO15194 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSPLO15194 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSPLO15194 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSPLO15194 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSPLO15194 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSPLO15194 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSPLO15194 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSPLO15194 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSPLO15194 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSPLO15194 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTDSPLO15194 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTDSPLO15194 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTDSPLO15194 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTDSPLO15194 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms