Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01387J3KSC0 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms