Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCER2I3L3R5 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms