Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMB4A4D0S4 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMB4A4D0S4 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms