Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM2AQ9Y2K7 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM2AQ9Y2K7 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms