Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PNMA8BQ9ULN7 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms