Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NRXN1Q9ULB1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NRXN1Q9ULB1 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms