Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP21Q9UK80 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms