Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIV1

CNOT7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT7Q9UIV1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNOT7Q9UIV1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNOT7Q9UIV1 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms