Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms