Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
REREQ9P2R6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
REREQ9P2R6 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
REREQ9P2R6 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
REREQ9P2R6 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
REREQ9P2R6 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
REREQ9P2R6 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
REREQ9P2R6 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
REREQ9P2R6 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
REREQ9P2R6 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
REREQ9P2R6 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
REREQ9P2R6 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
REREQ9P2R6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
REREQ9P2R6 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
REREQ9P2R6 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
REREQ9P2R6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
REREQ9P2R6 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
REREQ9P2R6 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
REREQ9P2R6 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
REREQ9P2R6 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
REREQ9P2R6 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
REREQ9P2R6 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
REREQ9P2R6 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
REREQ9P2R6 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
REREQ9P2R6 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
REREQ9P2R6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
REREQ9P2R6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
REREQ9P2R6 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
REREQ9P2R6 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
REREQ9P2R6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
REREQ9P2R6 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
REREQ9P2R6 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
REREQ9P2R6 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
REREQ9P2R6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
REREQ9P2R6 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
REREQ9P2R6 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms