Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
VAPAQ9P0L0 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms