Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TVP23BQ9NYZ1 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23BQ9NYZ1 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.1 ms