Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD15

SRA1, Steroid receptor RNA activator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRA1Q9HD15 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRA1Q9HD15 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRA1Q9HD15 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRA1Q9HD15 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SRA1Q9HD15 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRA1Q9HD15 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms