Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms